（一）心理健康教育理念不足
目前高等学校在进行心理健康教育过程中部分存在新媒体运用不足、新媒体使用时间短等情况，同时学校也存在着微信、微博、官方网站、论坛等服务学生时间不足、维护人员重视不够等情况，在开展心理健康教育方式上仍以宣讲、讲座、海报等传统单向灌输、传播方式为主，这是因心理健康教育理念不到位，没有将新媒体与大学生心理健康教育理念在认知上有效结合，传统心理健康教育模式仍占据主体地位，仍采用线下教育为主的教育模式造成心理健康教育工作缺乏针对性。
（二）心理健康教育工作中新媒体运用趋于形式化
高校心理健康教育工作过程中新媒体与心理健康教育工作没有做到有机融合，新媒体工具自娱自乐或者孤芳自赏状态颇多，心理健康教育工作面对新媒体无能为力，对学校开设的心理健康教育与咨询网站缺乏合理有效运用，学生不关注、学生不感兴趣造成心理健康教育工作者鞭长莫及，新媒体心理健康教育工作形式化愈演愈烈，新媒体仅仅成为心理健康教育的传播平台，其具有针对性、高实效功能不能够服务学生。
（三）教师对健康教育缺乏认同
一方面体现在心理教师对使用新媒体开展心理健康教育缺乏认可度，有数据表明高频率使用新媒体开展心理教育工作相对于不使用新媒体的认同度偏高，心理教育工作者要主动尝试使用新媒体，做到顺应时代潮流，融入学生、融入社会；在使用新媒体的同时迎合学生兴趣点、融入学生群体，了解并关注学生喜欢的话题与交谈热点，通过新媒体对学生认知与观念进行正确引导，
另一方面体现在教师对心理健康教育工作缺乏认同，部分教师认为自身主要职责为教学工作，而学生心理健康教育认为是学校管理工作，应该由心理健康教育工作者或心理辅导机构来开展，对学生开展心理健康教育的使用归功于一线心理老师，思想上对心理健康教育存在片面认识，而未认识到心理健康教育是全体学校教师的职责。
（四）心理健康教育队伍信息更新不及时
目前高等学校心理健康教育覆盖新媒体信息的理论一般，通过运用新媒体技术对学生开展心理咨询和辅导的理论与实践尚未成熟，同时开展心理辅导和咨询的实践能力和综合素养不高，面对新形势下高校学生数量增加、学生特性突出情况，心理健康教育在教师队伍构成、心理教师数量与质量上未能够及时跟上新媒体时代学生心理变化步伐，同时距离相关标准有一定距离，部分心理健康教育工作者在运用新媒体开展心理咨询与辅导工作中出现不会用、不想用甚至不用的情况，这对于拉近与学生距离、减少与大学生之间代沟及时开展工作是很不利的。
（五）心理健康教育载体需强化
一方面体现在心理健康教育平台需要进一步整合与开发，大部分高校都创办了关于大学生心理健康教育的网络平台，如论坛、网站等，而同学们对学校开设的心理健康教育平台效果不认同，同时认为学校在网站发布关于心理健康教育方面的资讯过于官方，不利于学生们接受；心理健康教育平台需进一步整合开发与创新，应运用微信公众号、微博等新媒体手段与网站、论坛甚至是传统教育载体相互结合的方式，激发学生参与心理健康教育的热情。
另一方面心理健康教育载体内容需要丰富，目前在校大学生普遍通过网络认知世界、获取信息，在宿舍或者家里的时间相对较长，多数学生对学校是否开设心理健康教育课程不了解，高校普遍没有开设心理健康教育方面的公开课，学校可以通过运用公开课的传播优势，增加公开课的数量，提升公开课质量，在公开课与网络课程中引入实兴话题与题材，吸引学生开展相关方面的教育与探讨。
（六）心理健康教育管理尚需完善
一方面体现在学校未形成校、院、学生或者专业心理咨询师、学院、宿舍三级心理健康教育联动机制，采用简单的调查问卷、观察、反馈等方式对学生进行心理筛查或引导，未形成一种相互合作的多层次的心理健康教育模式。