我国的企业集团大部分于二十世纪八十年代之后成立，并且很多都是大型国有企业，经过几十年的艰苦奋斗，不断地扩张和发展，逐步建立起以股权为主要纽带，以现代企业制度为基础的母子公司体系。但对于大部分企业来讲，与西方发达国家的跨国公司相比还有较大差距，特别在集团财务控制和资本运作方面还明显落后，管理经营尚带一定行政色彩，跨国经营失败案例很多。尤其是我国加入WTO以后，我国企业集团要与国际跨国公司展开正面竞争，面临着更严峻的挑战。
1.过度集权致使财务体系僵化。过度集权是一种极端的财务控制机制，主要存在以下问题：一是集团公司不了解下属企业实际情况，滋生官僚主义，搞一刀切，以致决策失误；二是抑制了下属企业自主经营的积极性、创造性和灵活性，不利于下属企业快速发展；三是决策审批流程复杂，耗时太长，延误了最佳决策时机，丧失市场机会。
2.过度分权致使整体利益受损。与过度集权相对的另一种极端的财务控制机制是过度分权，分权过度主要存在以下问题：一是成员企业财务战略目标不一致，各行其是，制约了企业集团财务目标的整体实现；二是集团公司对下属企业发号施令很难得到落实，成员企业间资源调配将受到严重阻碍，不利于全集团范围内资源的优化配置；三是抑制了集团规模经济效益的有效发挥，丧失了比较优势，市场竞争力下降；四是为私设小金库提供了制度漏洞，也容易产生公款挪用、贪污腐败的行为，违纪违法风险增大。
3.总会计师权责和素质不到位弱化了财务控制。在实际企业中，总会计师的原本职务职责被弱化，被增加了很多其他不相干的职务职责，总会计师没有足够多的精力对总经理行使经济监督权。职务的不到位，必然导致职责的不到位，个别总会计师被委派到异地企业，独自一人，易被所在企业同化，致使包庇财务漏洞，对企业的经营违规违法行为视而不见；总会计师作为企业高级的财务监督及管理人员，必须要有较高的道德品质和专业技能，但我国很多企业对总会计师的素质要求，仅局限于专业技能，忽视了道德品质，这也严重影响了企业财务控制的有效进行。
4.激励机制不到位致使财务控制缺乏积极性。由于委托代理关系的存在，掌握所有权的出资者将公司的日常经济管理委托给职业经理人，这必然会产生代理成本，进而影响了企业的运营效率和效果，因此，应该通过使经理人承担一部分风险（如持有公司部分股权或期权）的方式来引导其行为，对其产生一定的激励效果。