2019年3月18日，习近平总书记在全国学校思想政治理论课教师座谈会上发表重要讲话指出，我们办中国特色社会主义教育，就是要理直气壮开好思政课，用新时代中国特色社会主义思想铸魂育人。为马克思主义学院的设立指明了方向：提高思政理论课教学地位，让思政理论教育把好教育方向，培养中国特色社会主义的建设者。

上世纪九十年代中专院校（即今天很多高职院校的前身）都设有马克思主义教研室，直属于党委领导，肩负着全校思政理论课教学工作。进入新世纪后，中专院校纷纷升格成高职院校，中层开始设置系部与处室，思想政治理论课教学开始随各高职院校的党委重视程度而发生分化。在践行社会主义市场经济理论时，一些高校领导唯创收至上，轻视了思想政治理论课作用，在机构设置上，思想政治理论课教学部门成为低于系半级的二级机构，为了弱化思想政治理论课的政治性，把思政理论课教学管理部门名称改为“人文教学部”“基础教学部”“社科教学部”“素质教学部”等；有的学校把思想政治理论课教学机构设置成三级机构，并对思政理论课教师的工作量折扣计算，评职称时按专业教学人员的要求评定思政理论课老师，（思政理论课教师很难参与到教材编订中），从而既打击了思政理论课负责人的积极性，也打击了思政理论一线教师的积极性。

（一）设置独立的二级机构，便于思政理论课教师开展思想性、理论性、教育性于一体的教研活动。

作为思政理论课教师，要不断更新思想政治理论知识，更新理论观念。一般院校的每周政治与业务学习分别由党总支与教研室进行管理。当思政理论课教师与其他公共基础课教师同处一个中层部门时，普通老师的政治学习其实就是思政理论课老师的业务学习，但普通老师的政治学习内容仅是思政理论课老师的业务常识，无助于提高思想政治理论水平。毕竟思政理论课老师们的政治理论学习，无论从广度到深度都要比一般的老师要求更高，且需要深入研讨，实质是将政治学习与业务学习合二为一，因此，设立二级机构的马克思主义学院的必要性由此可见一斑。
（二）马克思主义学院的设立为学校党委提供政策咨询。

高职院校的党委书记或院长大多由专业人士担任，精于学校的专业建设却疏于掌握思政理论课教学。为了弥补思政理论的缺陷，每年各级党校会对高职院校领导进行思政理论培训，同时教育部多次发文，要求校领导至少每学期要给学生上1-2次思政课，其实非思政理论专业的校领导能高质量完成思政课教学的不多。对此，马克思主义学院的院长或书记，要不断将最新的思政理论课的规定及时与校级领导沟通、宣传，真正让中国特色社会主义的办学理念贯彻到学校的整个教学过程中。

（三）提高思政理论课教学部门的地位

高职院校领导重视专业课建设轻视思政理论课建设有其历史渊源。上个世纪九十年代之前，不管是本科院校还是中专院校，学校只负责教学，并不负责经费的筹措，而九十年代后，教师的福利与学校的创收密切相关，专业课在创收的培训班中起主导作用，思政理论处于从属地位；随着教育体制的进一步改革，公办高职院校获得的年度财政拨款取决于招生人数，即学校的专业质量及设置与思政理论课教学的质量并没有必然的直接的联系，因此，即使高职院校的领导迫于形势而愿意设置马克思主义学院，但在人员配置上会想方设法压缩。

高职院校马克思主义学院的设立是为了提高意识形态教育的地位，更好地开展思想政治理论课的教学与研究，更好地协调各相关部门开展学生的社会实践活动。从机构级别上看，把马克思主义学院与其他系级别等同，提高了思政理论课教学管理人员的积极性，便于思政理论课教学管理人员与其他部门负责人的沟通与协调，在教学安排中思政理论课有优先于专业课安排的权利，保证了形式上的思政理论课的优先地位。但在调动思政理论课教师的积极性上作用并不显著。