1、统一了行业会计制度，增强了行政事业单位会计数据的可比性
实施已久的十三个行业会计制度终于在政府会计制度出台的同时退出了历史的舞台，它们曾经在很长的一段时间里指导着各个不同行业行政事业单位的会计核算工作。但是，由于不同行业执行的会计制度不同，核算方法上必然存在较大的差异，给政府部门在汇总行政事业单位报表或统计有关数据时带来了很大困难。政府会计制度的出台，统一了不同行业行政事业单位的会计核算方法，简化了汇总报表或统计数据的工作量，同时也增强了不同行业间行政事业单位会计数据的可比性。
2、引进了权责发生制，充实了行政事业单位会计核算的内容
政府会计制度引进了权责发生制，较以往的收付实现制更能客观、准确地反映出行政事业单位的真实家底，增强了财务会计功能。权责发生制还能更好的促进同一单位不同时期会计数据的纵向比较，对业务的开展能够提供有效合理的分析数据。同时，政府会计制度没有摒弃收付实现制，而是将权责发生制与收付实现制融合，使财务会计和预算会计既适当分离又相互补充，实现双功能、双基础、双报告体系，既满足了财政部门对于行政事业单位预算收支管理的控制，也解决了原制度下行政事业单位资产虚高、偿债能力不明晰的现象。权责发生制要求所有行业的行政事业单位均要对固定资产提取折旧、对无形资产计提摊销，能够更客观真实地反映出单位的净额；对往来款项提取坏账准备、对涉及跨年的费用支出实行摊销和计提，不再是原制度下应收、应付往来款项长期宕帐，费用发生收支不均衡的现象，有效提升了行政事业单位的资产管理能力。
3、进一步推动了行政事业单位绩效管理工作
政府会计制度扩充了资产和负债的核算范围；从原来预算会计的5要素会计核算模式转变为政府会计制度的5+3要素会计核算模式，引进了成本费用概念，使得资金使用效率更准确地得到体现，为预算绩效管理工作提供了依据。把原来单独建帐核算的基建工程业务整合归并进了新制度下的会计核算，更加明确细致地规定了公共基础设施、文化资产等的核算、增加了预计负债概念等，有利于行政事业单位更好地统筹管理资产，提高资产的使用效率；合理估计行政事业单位的偿债能力，体现了谨慎性原则。这些财务数据能够帮助行政事业单位分析财政资金的使用效益是否最大化、各项绩效目标的设置是否合理，将结果应用到业务安排中，提升政府部门的履职能力。