1,软件人才的培训结构和层次不尽合理，软件培养模式比较单一，过于依靠正规院校培养，造成人才结构失衡。我国大部分软件人才来源于正规院校。据统计，目前从业的软件人员中，3/4以上来自全国各高等院校或科研院所的软件相关专业毕业生，来自职业技术学校以及社会培训机构的软件从业人员不足总数的1/4。这样一方面造成软件人才的知识结构，学历结构单一；另一方面在限制国内软件人才绝对数量增长的同时，也造成了软件人才层次不清，制约了软件人才结构进一步优化。与此同时，这些人才所占软件人才的比例很大，基本上属于中端软件人才，做程序员不能充分发挥作用，做系统分析师又难以胜任，从而造成了国内软件人才的“橄榄型”结构，非常不利于我国软件产业发展。
2，人才培养与产业发展需要脱节，难以学以致用。我国缺乏根据市场和产业发展实际需要定制软件人才的培养体系。长期以来培养的绝大多数是中层软件人才，而产业发展急需的“软件蓝领”十分匮乏。同时，培养出来的软件人才实际操作能力不强，普遍不熟悉国际标准，工程和技术规范，再加上现有的教学体制比较、陈旧、落后，适应产业发展人才培训需要的教材、师资等严重不足，严重影响了人才的学以致用的能力培养。另外，在软件人才和企业之间也缺乏一个有效的过渡阶段。
3，国内软件人才培训认证缺乏统一标准，培训机构存在恶性竞争。目前，我国软件人才培训市场还刚刚兴起，尚未完全走向正轨，缺乏公正、公平的竞争环境。培训机构和培训市场管理不规范，培训认证缺乏统一标准，师资良莠不齐，教材陈旧落后，培训质量低劣，培养出的软件人才水平不高，难以适应产业发展的需要。