新课改要求高中生评价实行学分制，包括社团活动、社会实践和课题研究在内的综合实践活动参加情况，都将占据一定的学分。不仅如此，近两年来，高校自主招生愈演愈烈，学习成绩好、综合素质突出的学生成为“小高考”青睐的目标。但是受学习压力大、经费难筹、安全限制等因素的影响，高中学生社团大多处境尴尬。有不少社团“营养不良”，活动次数不多，参加人数有限，甚至“昙花一现”。首先是影响成绩，学生在组织社团活动时，占用时间比较多，甚至有的社团成员把主要精力用于社团活动，荒废了学业，这就影响了正常的学习进度，导致有的社团要求每个团员加入前都要写成绩担保书，成绩退步的将被退团。其次，经费是难以逾越的第二道障碍，大多数社团的活动经费由团员自筹，校方对社团的支持更多只能体现在提供活动场地和时间上。社团更迭过快，学生流动过快，社团稳定性不够。第三，担心影响安全，加上指导老师的缺乏等，有的学校干脆叫停了部分社团。
尽管高中课改提倡学生全面发展，但成绩依然是衡量学生素质的最重要“标识”，加入社团的多为高一学生，高二学生涉足不多，高三学生更是完全成了旁观者，更多的家长和老师认为，除非学生成绩很好而且很稳定，或者有某方面的特长，打算从事相关的工作，否则最好不要把时间浪费在搞活动上。此外高校自主招生现在仍是“少数人的游戏”，大多数学生仍要挤高考这座独木桥，高考的选拔模式不改变，素质教育就是空谈，学生社团活动也就难以真正红火起来。