目前一些专业课教材中很多都编写了思政内容，但大多都存在一些问题。
1.简单化：专业课教师多年延续以传授专业知识为核心的思维模式和习惯，对于进行"课程思政"改革存在一些理解不到位的情况，普遍存在思政领域知识积淀不足，对政治教育理论和形势政策认识不到位，找不到与专业结合的思想点，较难把握“知识传授”和“价值引领”的内在辩证关系等问题，写的内容不够到位。
2.两张皮：思政内容与专业内容没有实现融合，彼此分离，显得突兀，达不到从专业知识到思政育人的自然升华。
3.教学内容不够规范，随意性大：目前专业课教师对于"课程思政"内容讲授实际上有较大的自由裁量权，对于讲什么、讲多少、怎么讲，有较大的随意性。如果处理不当，出现无心"念歪了经"的情况，就会影响到课程思政的育人目标的质量，甚至可能造成相反的效果。
4.形式上过于随意，不够严谨。作者所设置的一些板块，有的较为凌乱，有的与专业内容不匹配。
5.缺少参照标准和培训。相比专业思政课规范的教材和教参，现行的专业教材缺少思政元素编写参照，也缺少培训，作者各自根据自己的理解和解读程度，去组织编写思政内容。由于各位教师自身的自觉程度和素养的参差不齐，难以保证专业课程教材编写质量。