由于对“以学生为本”理念的种种误解也造成了理念落实过程中的实际困难。现就“以学生为本”视角下教学督导工作存在问题做简要的分析。
(1)教学督导多以教师为主要对象
高校的教学督导队伍以专业能力强和教学水平高退休教师教学经验或有丰富的兼职教师为主体组成，对教学活动的正常监察和青年教师教学能力的提升起到较好的督导作用。但是督导往往容易站在教师的角度去评价课程的组织情况，对接受教育的学生的需求未进行掌握，没有从学生发展的角度进行督导。
（2）教学督导自身能力提升机制缺乏
随着科技的进步时代的发展，特别是互联网深入到教育教学领域和日常生活当中的各个方面，在校大学生接受知识的方式、听课的倾向、获取专业技术内容、阅读习惯呈现多元化。面对“90后”大学生网络生活习惯特点，教学督导工作如何有针对性的开展已摆在我们面前的新要求。
目前，高校的教学督导专员主要是退休教师离职后返聘，他们教学经验丰富或教学效果突出，但不等于教学督导能力优秀。对于新的教育教学理念的学习和了解机会不断减少，出现对新理念新要求新目标的理解不到位等情况。部分督导不能适应当前互联网信息平台迅速发展新的教育教学环境，面对学生兴趣高昂 的多媒体授课、双语教学、实验场所教学，只能从传统的教法和教学技巧上发表意见，出现不能切实关注学生的需求，满足现代教育教学督导需要的问题。然而，各高校普遍存在着对教学督导自身能力提升机制缺乏。
（3）二级督导工作的缺陷
二级学院教学督导是教学督导大系统中的一个了系统，与学校的督导相比更为微观、更具体，他们熟悉本学院各专业的教学规律，最具有条件对本学院学生的学习需求和人才培养各教学环节进行督导。但现实上他们主要的精力放自己担任的课程教学任务和教务工作上，督导工作仅满足在完成了听多少节课的层次上，关注的多为学生是否迟到，是否参与互动，是否上课玩手机等细节，未能发挥出二级学院教学督导的作用，从“以学生为本”的理念上审视思考本专业教学督导工作基本上没有进行。
（4）教学督导范围不能覆盖学生的全面发展
我们是否有这样一种感觉，一提到“督导”，第一印象往往是在课堂听课，在资料室查阅试卷、毕业设计等教学资料，或者在各类教师评奖、评优中点评指导青年教师，督导内容集中在课堂教学。对人才培养方案、实践教学活动、教学的管理、教学条件建设等方面覆盖率相对很低，对各年级学生出现的学习困难问题、学风倾向、学生的需求几乎没有 及到，更谈不上对其进行深度分析，找出导致的原因和提出改进的措施，提供学校及时处理和解决。