(一)审计目标。
主要目的是通过审计，促进职能科室负责人履职尽职，带动整个科室提高管理和服务能力，最终全面提升公立医院管理运营水平。
(二)审计内容。
职能科室负责人是公立医院运营的中间层，其不仅要上传下达，还要负责具体方案的实施，对其进行履职审计，是将审计的重心前移、下移；履职审计在关注经济方面的同时，更要关注业务层面[1]。审计组把以下六个方面作为对职能科室负责人履职审计的主要内容，一是贯彻执行国家对卫生系统的方针政策情况，二是遵守法律法规和财经纪律情况， 三是近年来科室目标责任制完成情况，四是科室预算执行和经费支出的真实、合法和效益情况，五是固定资产的管理情况，六是科室工作人员遵守廉政规定情况；同时结合被审计科室的具体工作职责和上级各项考核要求。
(三)审计方法。
1.充分准备。
医院职能科室具有较强的专业性，如医务处、医疗设备科、护理部和信息科等，这些科室工作人员都具有其专业背景；即便像总务科、保卫科等后勤保障部门，因为与医疗业务相关联，也变得极具行业特点。为避免审计过程中出现“卡壳”、效率低下等问题，审计组在进驻每个科室前，积极查阅年度工作计划和总结，研究内部工作制度和流程，访谈科室工作人员，同时要求职能科室自评《江苏省三级综合医院评审标准实施细则（2019版）》对应的条款；通过前期准备工作，了解科室的人员情况、主要工作内容和日常管理等情况，然后制定审计工作方案。
2.借助外部力量。
审计履职情况，就需要紧抓业务这条主线，为审透、审实，在实际工作中，审计组除实际查阅相关资料和盘点外，还寻求外部力量的支持。一是组织问卷调查，让其管理、服务的临床科室对其进行多维度的评价；积极请教院内老同志，特别是那些在该科室工作过的人员；向相友邻医院相同业务科室的人员咨询。
3.通过多种审计技术方法，确保底稿质量。
查摆问题，须用事实说话，不能想当然、主观臆断。审计组通过询问科室及临床业务科室人员，同时组织问卷调查，多方面了解科室负责人管理能力水平，以及存在的问题。通过监盘，全面清点科室固定资产的管理情况。通过重新执行科室具有审批权限的业务，查找是否存在内控缺失。通过审阅之前文件，发现有无审批不严等情况。还有通过重新计算、询问等办法，发现其个人和科室管理上存在的问题。一切要严谨求实，以事实说话，确保审计工作质量。