《专业综合实践》课程目标定位于学生在学习完专业全部核心课程的基础上，在专业课程体系视野范围内，依托全部或者绝大部分核心课程内容，甚至吸收相关专业的理论和技能，发挥顶石课程（Capstone Course）作用的融会贯通性，发挥学生自主探究性，通过运用多种技术方法、手段，进行综合训练的一种多元目标的复合型实践课程，强调学生能将学过的理论与实验知识及技能融会贯通，在培养学生实践能力和创新精神中有着极为重要的地位。但因为要求高及开设时间晚，在实施过程中遇到一些突出问题。
1.综合实践内容认定标准待确定
学生在前期所进行的课程实验是跟随对应的课程，是课程理论的验证和应用。而综合实践以学生专业核心能力形成为基准，强调专业核心课程的综合运用，因此需要研究专业综合实验的科学分类方法，给出不同类别专业综合实验的界定标准，以此作为后续不同类别综合实践项目开发的依据。
2缺乏教材和实训指导书
2016年开设以来，缺乏专门面向新工科背景下电子信息类专业的《专业综合实践》教材和实训指导书，限制了该环节的有效实施。
3承担《专业综合实践》教师指导经验不足
目前，随课程的实验一般由任课教师指导，大多教师仅仅只精通专业领域多个学科的其中一个，缺乏新工科背景下更加强调多学科融合创新发展的技能，使得一般教师难以指导综合实践课程教学。
4综合实践平台亟待建设
原有实验室主要针对课程实验进行建设，实验设备和仪器只能满足针对课程的验证性、综合性及简单的设计性实验，难以满足多学科融合和创新性实验的搭建、验证和测试需求。