1.教学内容和材料陈旧
随着科学技术的不断发展，生物化学知识和实验技术也在不断更新，新技术、新方法、新知识日新月异如雨后春笋般涌现。但是，学校的生化实验还在固守成规，只停留在课堂教学教材阶段，与现代生物化学学科发展现状相差甚远。生化实验缺少实践性和创新性，仅仅是教授简单的定性或定量的基础实验为主，这些情况基本上是大部分高校在教授实验课程中都有的现状。潍坊科技学院安排的生化实验课程主要有植物DNA、RNA的提取 、质粒的提取、PCR扩增检测、琼脂糖凝胶电泳、Folin － 酚法测定蛋白质含量、总糖的测定等基础性验证实验，课程内容仅仅是重复实验而不是让学生主动思考设计实验，这种教学模式非常不利于学生创新性的培养。
2教学方式单一
传统的生化实验教学方式大多都是“灌输式”教学，以老师为主体。课前老师准备好实验材料、试剂以及仪器设备等准备工作，课上老师讲解实验目的、实验原理、实验步骤和注意事项，然后学生就按部就班的照搬实验步骤就可以完成实验，课后根据实验结果撰写实验报告。这种教学模式直接导致学生对实验课程兴趣低下，整个过程只注重结果缺少学生自主思考的过程，学生仅仅是被动的接受加上机械化操作，并不知道为什么这样做、这么做的意义在哪以及还有没有别的实验方法也能达到同样的效果等问题，结果只会导致学生学习缺乏主动性、积极性和创新性，不能达到学校开设生化实验课的真正效果。
3实验条件落后
学校经费有限不太注重实验室建设，新型实验仪器无法引进，这就导致有些高端的实验无法开展。学校设立的多个专业都涉及到生化实验，例如离心、电泳、分光光度计比色等技术，由于使用频繁加上维护措施不够导致一些建设实验室初期购入的实验仪器出现故障。有的精密仪器长时间使用也会失去准确性，例如分子实验都会用到的移液枪，如果使用不当或者长时间不维护很容易造成测量不准影响实验结果。这些硬件设施的缺乏是学生开展生化实验课程最大的阻力，实验设备、条件不齐全就算学生再积极主动在操作上也会遇到障碍。