1在教育理念上，重智育，轻德育
社会发展需要高综合水平的医学人才。高校扩招后，医学生的总体学历水平较高，但高学历不等于高综合水平。近年来我国医学教育出现被边缘化和形式化的现象。在具体教学实践过程中对人文教育存在着重视不够，相关课程教学内容与工作实践脱节等问题。医学人文精神的缺乏不利于构建和谐的医患关系，不利于抵制市场经济的负面影响，不利于促进医学事业的健康发展。
2在教学方法上，重肯定，轻批判
现代医学教育环境下需要融汇中西方医学的临床医学人才。传承中医经典，是培养名医的关键；研习现代医学多种疾病及用药指南，是成为合格临床医师的基础。医学的发展日新月异，批判性思维作为全球医学教育最基本要求之一，是医学不断创新发展的保障。研究显示，我国医学生批判性思维能力整体较弱，且受个人、学校、社会等多方面的影响。学校及医院的考核仅重视测试认知层次，缺少思维及综合能力等多方面的评价测试；测试范围主要以课堂知识为主，缺少情景测试，批判性思维能力不能得到很好的锻炼，阻碍了其批判性思维能力的发展。
3在教育内容上，重治疗，轻防控
现代社会的医疗研究重点一直在药物机理及治疗疾病等方面。但是，医疗卫生事业的落脚点是全民健康，治疗疾病只其主要手段之一，防控疾病的发生是实现全民健康的关键。尽管，经历疫情后，防控意识有所提高，但是在总体实践上却贯彻落实的不够彻底。在课程设定上，相关内容常被作为限选课或者选修课，并存在通识教育能力不足，理论与实践教学脱节等缺陷，最终导致学生存在医学思维狭窄、能力不足等问题；所以，疫情来临之时，医学生普遍存在防控意识匮乏的问题。
4在教学资源上，重投入，轻配置
21世纪以来，国家高度重视医学教育的发展，但医学教育资源及医学人才在地域之间仍存在配置不合理的现象。省级、国家级重点课题，走在医学前沿的疾病指南、顶尖的医疗技术、高精尖医疗器材、疑难病例讨论、全国重点疾病专科，高学历高水平的医疗人才大都聚集在发达城镇，分布在农村地区少之又少。疫情发生后，基层医疗更是因为两者医疗教育、科研及医疗水平相差甚大而呈现更加发展不平衡的状态。