1、监控线上同学是否自觉地在线学习问题
一般来说，教师根据发送二维码或者定位来判定学生是否进行网络签到，以查明学生是否到课实时学习，但不很准确，有些对思政课不感兴趣的同学会投机取巧，签到后，把手机或者电脑开启放到一边，自己干别的事情去了；有些线上同学根据老师教学习惯，揣摩到提问环节或者课堂练习环节，然后只在这一时间段在线应付。
2、线上线下教学怎样混合、怎样协同问题
如果全部是线上教学或者全部是线下教学，就不存在混合式协同教学的问题；但是如果大部分是线下课堂教学，少部分要线上教学且要同步进行的话，就有了混合式协同教学的问题。而怎样同步协同，是一门新的学问，最忌惮的是顾此失彼。很多时候老师最容易犯的毛病是把手机电脑视频打开，只管自己线下上课，忘记了还有线上同学的所需所想。把线上线下混合式协同教学等同于传统教学。
3、线上线下混合式教学缺乏学生自主性，师生互动缺乏
有些是教师课堂内容设计不科学，有些是由于老师在技术操作上不熟练，对于怎样实现同步协同教学的设计以及信息传送，课堂内容设计怎样有利于信息传输，提取和发送信息做到不卡壳、不断线不好把握，对协同教学有何顾忌、有何担心，索性只把理论知识讲解完事，把教学变成了“一言堂”。学生没有参与课堂教学活动，没有师生互动，也就使教学失去了趣味性。
4、线上线下混合式教学演变成花里胡哨的教学形态或者让学生单独观看教学演示视频
有些教师可能把线上线下混合式教学演变成另一个极端，不断播放与理论教学不很紧密的各种视频以博得学生的喜爱，把教学的主导权也交给了学生；或者把书本知识搁置一边，只讲线上同学的看法和议论；有些教师可能把多媒体上已有的名家讲堂的教学视频长时间地放给学生观看，认为名家比自己讲得好，失去了教师应有的教学生动性和艺术性。