各个高校把数学建模课程当作一门核心课程进行讲授，以数学建模课程为平台培养学生的综合素质，无论是数学建模课堂教学还是数学建模竞赛当中都存在一些问题[3-4]。
1 课堂教学中的问题
首先，数学建模课堂教学内容偏理论，缺乏实践环节。目前大部分高校数学建模课程的教学方式是案例分析法，即每一次课讲一个实际案例，这种教学方式主要由问题分析、模型假设、构建模型、模型求解等部分构成，有时会有模型解释和验证，这些环节与整个数学建模过程相比较相差甚远，而且整个案例分析过程只有老师在台上讲课，学生缺乏独立思考，没有完全掌握数学建模核心技巧，最终的教学效果不佳。其次，学生的计算机应用能力较差。数学专业的学生从问题分析到模型建立勉强可以完成，但是模型求解时由于缺乏计算机技术的能力，大部分模型都无法求解，更不能完成后续步骤。此外，学生的数学水平较差，动手能力不足，先修课程内容掌握不够等原因，整体课堂教学达不到预期效果。
2 学科竞赛中的问题
1992年举办第一届全国大学生数学建模竞赛以来已经有近三十年历史，越来越多的高校重视数学建模竞赛的参与度，人数也逐年递增。大赛之前，每个高校组织教师举办赛前培训，在培训会上经验丰富的指导教师会带领学生们回顾往年赛题，讲解解题思路，培训信息查询能力、计算机技术，如MATLAB，SPSS等常用的数学软件以及论文写作技巧。但是这些培训都是短期的，数学建模所涉及的到知识面比较广，不仅是数学知识，甚至是交叉学科的知识也会用到，加上软件、文献查询、写作技巧培训等多个环节，学生掌握的知识严重不足。同时赛前培训也说明数学建模课堂教学与学科竞赛严重脱节，竞赛中所需知识并没有在课堂上进行有效讲解。
还有一部分学校没有赛前培训，由于学生的学习水平较差，参赛积极性不高，赛前很难组织培训会，这会导致第一次参加比赛的学生毫无头绪，不知道要干什么，等到自己有一些思路时已经过去一半的竞赛时间了。即使有过参赛经验的学生在软件的使用、论文的写作等方面都存在非常多的问题。由于数学建模课堂教学与学科竞赛中存在各种问题，很难培养学生解决实际问题的综合能力，学生更不会有数学建模的思考方式。