1、财务报表分析能有效控制公立医院的运营成本，提高经济效益。
财务报表分析能将医院的各项收入、支出、资产、负债、净资产及其运营情况清晰地展现给报表的相关使用者，使管理层及上级主管部门能及时根据医院的实际经营状况，做出正确的决策判断，及时规避潜在的财务风险，从而提升医院整体的经济效益和社会效益。
2、财务报表分析可以为医院内部控制的有效实施提供参考依据。
医院的会计报表并不能直接反映医院内部控制的执行情况，但是通过各类指标的分析，可以为医院内部控制的有效实施提供参考值较高的信息。例如，通过对收入费用表的分析，可以发现支出中存在的不合理因素，并采取一系列的内部控制措施予以改进；通过对现金流量表的分析，可以使管理层及时掌握医院资金的短缺情况，并采取相关内部控制措施来降低药品、耗材及设备的资金占用问题。
3、财务报表分析为医院开展内部绩效考核提供有效的数据支持。
成本报表既能够分析医院总体的支出情况，也可以细化分析每个临床科室的支出及相关业务情况，甚至能够精确到每位员工的工作情况，将成本报表分析与医院内部开展的绩效考核相结合，既是对员工的一种鞭策，又能有效提升他们的工作热情和主观能动性，同时使管理层对员工的工作开展情况更为了解，也更有利于内部绩效考核工作的推行。
4、财务报表分析是对预算执行情况的考核与监督。
预算执行情况是对本单位预算的完成质量、执行进度以及各项收支、盈亏等进行分析，如果财务指标与预算执行情况接近，则说明医院较好地完成了年初制定的各项既定任务，预算管理工作开展的质量较高，医院正朝着良性的方向不断发展；反之，则说明预算管理工作开展情况不佳，医院各项支出未能严格按照“无预算不支出”的原则执行，在经营管理方面存在一定的漏洞。