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ADD3可变剪接在结肠癌与正常组织间差异表达的检测与分析
 
更新日期:2024-01-04   来源:中国病理生理杂志   浏览次数:276   在线投稿
 
 

核心提示:结直肠癌(colorectalcancer,CRC)是消化道最常见的恶性肿瘤之一,全球第三大最常见的癌症,是因癌症死亡的第二个最常见疾病,每年约有608万人死于CR

 
结直肠癌(colorectal cancer,CRC)是消化道最常见的恶性肿瘤之一,全球第三大最常见的癌症,是因癌症死亡的第二个最常见疾病,每年约有608万人死于CRC[1]。CRC发生发展的病理机制十分复杂,仍不十分清楚。目前认为,基因突变是癌变过程中最早涉及的初级遗传事件,而在CRC发展过程中将会引发次级分子事件,即基因表达改变,如差异性表达、可变剪接与融合基因。近几年,一些基因表达的可变剪接体与肿瘤的关系受到重视,γ-内收蛋白(gamma adducin,ADD3)可变剪接体就是其中的一个。已有报道ADD3可变剪接的表达差异跟非小细胞肺癌[2]及小鼠乳腺癌细胞[3]有关,本实验小组在前期工作中发现一例CRC患者的ADD3可变剪接在CRC与正常组织的表达存在差异[4],这些均引起我们进一步探讨ADD3可变剪接体与CRC关系的兴趣。
ADD3是人类内收蛋白γ亚单位基因,定位于染色体10q24.2-24.3,含15个外显子。ADD3是1986年Gardner等在红细胞中发现的一种细胞膜骨架蛋白,其有参与细胞膜骨架网状结构构建和维持、细胞信号转导、细胞膜离子转运等多项生理功能[5]。由于启动子选择和剪接方式不同,ADD3基因产生3种mRNA差异剪接体,即变体1(variant1),变体2(variant2),和变体3(variant3),表达2种蛋白:ADD3亚型a(isoform a),由变体1翻译,表达第14号外显子;ADD3亚型b(isoform b),由变体2和变体3翻译,第14号外显子表达缺失。本研究探讨CRC中,总ADD3 mRNA(ADD3-T)、ADD3亚型a(ADD3-Ia)和ADD3亚型b(ADD3-Ib)的变化及其意义。

材 料 和 方 法
1 组织和细胞
1.1 CRC和息肉组组织 在知情同意的情况下收集2012年9月~2013年6月于本院胃肠外科及肿瘤外科手术的50例CRC患者的癌组织及距离癌灶>5cm的上游正常粘膜组成配对样本,20例息肉患者在肠镜下取出的息肉组织及距离息肉>5cm的上游正常粘膜组成配对样本。所有样本均在20min内切下即放入RNA保存液,所有病例术前均未接受化疗,放疗及生物治疗,所有标本均经病理学检查证实。
1.1 结直肠癌细胞株 采用国内外通用,来自同一亲本,遗传背景一致的人大肠癌高转移性细胞株 SW620 和低转移性细胞株 SW480[6]。SW480购自中科院上海细胞研究所,SW620由福建省肿瘤医院研究室赠予。
2 主要试剂
RNA保存液、TRIzon总RNA提取试剂、GoldStar TaqMan Mixture(With ROX)购自北京康为世纪生物科技有限公司;RevertAid™第一链cDNA Synthesis试剂盒购自Thermo;不完全L-15培养基购自南京凯基生物科技发展有限公司;胎牛血清购自天津灏洋生物制品有限公司;胰酶购自Gibco;噻唑蓝(MTT)购自Amresco。所用引物和探针由上海英潍捷基公司合成,见表1。
3 主要方法
3.1 细胞培养 细胞置于含10%胎牛血清不完全L-15培养中,37℃,5%CO2 饱和湿度培养箱中培养,2-3天换液一次,实验用细胞为状态良好的对数生长期细胞。
3.2 MTT比色法 将SW620和SW480接种于96孔培养板,100μl/孔,每孔接种细胞数为2×103,每组设3个复孔,培养24h;吸弃孔中培养基,加入100μl含有浓度为0μg/ml、0.05μg/ml、0.5μg/ml、5μg/ml的奥沙利铂培养液或浓度为0μg/ml、0.01μg/ml、0.1μg/ml、1μg/ml、10μg/ml、100μg/ml的5-FU的培养液培养24h,加入5mg/ml的MTT 10µl,37℃孵育4h后小心吸去上清,加入150ul二甲基亚砜(DMSO),振荡溶解结晶后用490nm波长比色,评价细胞存活率。实验重复3次。
3.3 药物干预 将SW620和SW480接种于6孔培养板,2ml/孔,每孔接种细胞数为5×105,每组设3个复孔,37℃,5%CO2 饱和湿度培养箱中培养24h细胞贴壁后吸弃培养液,加入不含血清的培养液2ml,饥饿培养24h后分别换用含有浓度为0μg/ml、0.05μg/ml、0.5μg/ml、5μg/ml的奥沙利铂培养液及浓度为0μg/ml、0.01μg/ml、0.1μg/ml、1μg/ml、10μg/ml、100μg/ml的5-FU的培养液2ml,24h后用TRIzon试剂收集各孔细胞。实验重复3次。
3.4 FQ-RT-PCR 将收集的细胞和组织按照TRIzon总RNA提取试剂的操作说明书进行总RNA的提取,紫外分光光度计比色后选用A260/B280在1.8~2.0的标本1μg逆转录成cDNA。取50ng cDNA进行FQ-RT-PCR,95℃预变性10min;95℃变性15s,60℃退火60s,扩增40个循环。
4 统计学处理
采用国际通用的FQ-RT-PCR相对定量2-∆∆Ct方法[7]表示ADD3-T、ADD3-Ia、ADD3-Ib和ADD3-Ia/Ib的表达水平,实验数据采用均数±标准差()表示,两组间均值的比较采用t检验,病理分析运用非参数Mann-Whitney U检验,多组间比较采用单因素方差分析(ANOVA)LSD-t法,所有统计学处理均在SPSS17.0统计软件包上进行。
结 果
1 CRC组织
1.1 CRC组织表达量比较 ADD3-T在CRC中的表达水平较正常组织明显减低(0.704±0.334 vs 1.042±0.291,P<0.01),50例中有37例(74%)减低;ADD3-Ia在CRC中的表达较正常粘膜组织无显著性改变(0.942±0.571 vs 1.063±0.386,P>0.05);ADD3-Ib在CRC中的表达较正常组织明显减低(0.454±0.361 vs 1.097±0.497,P<0.01),50例中有42例(84%)减低;ADD3-Ia/Ib的比值在CRC中较正常组织显著升高(3.217±3.058 vs 1.051±0.361,P<0.01),见图1。
1.2 CRC组织病理分析 将50对CRC组织按照年龄(≦60岁vs >60岁)、性别(男vs女)、部位(直肠vs结肠)、大小(≦4cm vs >4cm);根据美国癌症联合委员会(AJCC,American Joint Committee on Cancer)和国际抗癌联盟(UICC,Union for International Cancer Control)结直肠癌TNM分期(第七版)划分深度(T1-2 vs T3-4)、淋巴结转移(有vs无)。比较后发现ADD3-Ia的表达量在T3-4组中为2.119±1.246,显著高于T1-2组的1.081±0.405,(P<0.05)(图2)。
2 结直肠息肉组织表达量比较
ADD3-T、ADD3-Ia和ADD3-Ib表达在结直肠息肉组织中分别为1.050±0.806、1.105±0.486、1.13±0.615,均较正常组织0.807±0.320、0.845±0.440、0.617±0.429减少(P<0.01);ADD3-Ia/Ib无显著性差异(P>0.05)详见图3。
3 SW620和SW480中的表达差异
ADD3-T在SW620中的表达量较SW480未见明显减少(P>0.05);ADD3-Ia、ADD3-Ib在SW620中的表达量较SW480减少(P<0.05,P<0.01);ADD3-Ia/Ib比值在SW620中较SW480升高(P<0.01),见图4。
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