图书馆创客空间生态系统主要有三大利益主体：创客、创客空间、企业和政府（当创客或创客空间寻找合作机构时，将企业与政府合并为一个利益主体即企业政府），三大利益主体的作用及其协同关系如下：
（1）图书馆创客。创客在该生态系统的创意主题，以图书馆创客空间为载体，通过线上和线下平台开展创意、创新研发、实践操作、形成最终创新创意成果。
（2）图书馆创客空间。创客空间为创客提供资金、设备、信息技术，以及创新创业基础性资源等，并积极与外界合作，如资源、技术和服务等的更新换代借以强化扩大自身的创新能力，并且寻求企业政府的资金政策的支持。1）图书馆创客空间为创客提供基础性服务，包括软硬件设备、互联网+技术、物理空间等。2）图书馆创客空间坚持以市场为主导的创新模式。在企业的加入下，创客空间以市场的发展趋势和行业的最新进展作为指导，为创客提供与市场对接的企业创新基础资源。
（3）政府与上下游企业。政府企业在图书馆创客空间生态系统中为创客和创客空间按提供资金政策支持。1）企业与图书馆创客的优势具有互补性。企业自身的创新创造能力有所欠缺，而图书馆创客的优势就在创新创造能力，但资金物质硬件设备有所欠缺。两者的合作便互相弥补彼此不足。2）企业可以逐步建立和完善创新人才培养机制。在企业与创客的对接中，企业技术人员对创客进行经验和知识的培训过程，也是发掘、挑选和培育对企业有用的创新人才的过程。3）企业可加强企业宣传，强化企业品牌效应。企业在对创客空间投资同时也提高自身的口碑和美育度，集合三方的力量，有效得争取政府扶持政策，在最终孵化成果中，可以提高企业的市场竞争力，实现名利双收。4）在合作过程中企业可减少试错成本，实现利益效率最大化。在与图书馆创客空间的合作中，可减少企业在产品研发阶段盲目投入研究经费，减少试错成本，且成效俱佳。
创客成果转化的两种模式：1）创客自行搜寻匹配的企业与之合作。2）创客以创客空间为载体由创客空间代为搜寻匹配的企业与之合作。无论采取哪种合作方式，创新生态系统的各主体都在寻求自身利益最大化，这样一来容易导致合作中矛盾冲突、创新成果转化效率低下，更甚导致合作失败的情况。