我国零售产业组织创新的效率稳步上升，但是不同业态组织创新效率表现差异较大，在规模、运营、绩效和规模效率等方面虽总体呈上升态势，但仍然存在着由于同业态同质恶性竞争而导致的效率相对低下等问题。下文将基于不同业态对我国商贸流通产业组织创新效率进行评价。
（一）不同业态规模效率评价
1、新零售的发展，对不同业态造成不同影响
本文选择了我国零售业中所占比重最大的五种业态，虽然不同业态之间存在较小波动，但从各业态总体发展规模来看，门店数量、销售额和从业人员都呈现出了不断增长的态势。
超市和专业店，无论在店面数量、从业人数、销售额都占据了主要份额，增长势头强劲。专业店因其在专业化产品与服务方面无以伦比的特色，在竞争中处于优势地位，迅速占领市场。而且区别于其他业态的是，专业店通过挖掘自身潜力，扩大单店规模实现了增长，相比而言其他业态更多的是依靠门店数量的扩张。2006年以来，专业店异军突起，超过了以前各指标均处于领先地位的超市，一举成为领先者，特别是那些能够线上线下融合发展的，比如苏宁，苏宁易购，发展迅速。通过研究发现，近年来传统零售行业不同业态里，向着新零售发展都相对较好，而那些保守经营的例如百货店，相对指标都有所降低。
2、不同业态之间的竞争，导致传统零售行业格局出现变化
由于电子、家电等产品专业店的不断发展，这些传统百货店的主要盈利产品，在百货店的份额不断缩小，导致百货店的发展趋缓。超市经营业同样也面临着分流和截流的问题，在一定程度上抑制了超市规模的扩张。具体体现在：超市的家电被专业店分流、食品被社区小食店分流、大店被小店截流、小店被马路摊点截流。我国零售产业一些业态面临着分流加截流的危机。
以此同时，我国零售产业不同业态之间的竞争日趋白热化。具体体现在便利店与超市竞争、折扣店同便利店竞争，各业态之间为了市场份额，出现了低效率竞争格局。不仅如此，不同业态之间的差别越来越小、商圈越来越杂乱、经营越来越困难。
（二）绩效水平评价
2002年以来我国零售通企业店效水平、坪效水平和人效水平都呈现出不同程度的增长，全部业态店效水平和人效水平增幅较大，而坪效水平则一路高涨中出现了波折，2008年迅速增加后2009年又出现的回落，但仍高于2007年的水平。可见，我国零售企业生产量不断进步，总体经营绩效不断增加。
我国零售产业组织创新过程中不同业态效率差异明显，不同业态增加幅度各不相同。由于专业店的突起，传统百货业和超市首当其冲受到不小的冲击，经历了2002年到2004年连续三年的下降。但是，2006年以后百货业依靠自身经营规模优势，通过创新，调整竞争战略，坪效水平不断回升，2009年达到了1.87万元，但仍低于全部业态的平均水平。