事业单位工作人员在人员性质上不同于公务员，也不同于企业员工，在人员考核管理上不能单向归于，而应根据事业单位工作人员的特质，借鉴公务员和企业员工考核中适合事业单位工作人员考核部分，不断调整完善，形成事业单位工作人员独有的考核。
（1）加大日常考核权重，重视日常表现。我国现行事业单位工作人员考核，大多侧重年终民主评议考核，采用“一票定终身”制。部分事业单位引用日常考核，但因年终评议考核的惯性思维，大多流于形式，没有将日常考核和年终考核有效的结合起来。为最大限度减少“晕轮效应”及“轮流优秀”，应当适当加大平日考核权重，充分体现日常工作的积累，提高工作人员对日常工作的重视程度，赋予日常考核一定的权重，通过日常考核结果的反馈修正年度内工作表现，充分发挥考核的作用。
（2）量化考核指标，制定行业指导。事业单位涉及领域较多，量化考核指标不能简单的从一而论，事业单位均为教育、科级、文化、卫生等行业的社会服务组织，行业考核指标的量化应当突出服务业绩，将服务绩效目标分解为各个考核细项，每一细项明确量化标准，服务评价等定性指标也以评价满意度的百分比等形式转化为定量指标，实现全部以量化指标考核绩效。建议根据行业特点，制定行业考核指标的量化指导，各单位在量化指导的基础上根据本单位的具体实际进行调整。
（3）细化考核内容，突出考核重点。现行事业单位工作人员考核缺少考核分层及定量指标，由此形成的考核结果大多采用“优秀”、“合格”、“基本合格”、“不合格”的描述，考核结果没有明确显示工作人员德、能、勤、绩、廉中各项的分数及等级，不能对本年度的考核以及下年度的改进指出明确的方向。建议对考核内容进行分项，并根据工作需要对每个分项赋予不同的权重，突出考核重点，充分发挥考核的导向作用。
（4）转化考核思路，以岗考人。现行事业单位考核形式多为年终民主测评考核，年终全体工作人员的测评大会成为了年终例行考核任务，尤其对一些人数较多、工作场所较分散的单位，民主测评重点考核工作人员的岗位职责达成情况，而不是仅仅以民主测评成绩考核工作人员本身。