近年来地方应用型高校的转型升级为大学生创业带来了契机，但我国目前除了经济发达地区的少数高校创新创业教育展开成功试点外，大多数高校的创新创业教育仍处于起步阶段，尚未形成课程体系，特色不鲜明，专业教育与创新创业教育相脱节，学科之间相互独立。
1.1人才培养目标模糊
应用型高校是培养具有实践能力和创造能力的复合型人才，但目前许多高校制定课程教学目标时，能力和素质的教学目标制定没有结合专业特点，目标不够明确，并未将社会真实的岗位需要作为人才培养的目标。创新创业课程只在选修课程中出现或是利用学生的课余时间进行小的讲座，尚未形成完善的创新创业课程体系。
1.2专业特色不鲜明
目前国内许多应用型高校的教学模式仍较为传统，无法体现地域特点和专业特色，没有紧跟社会发展的步伐。现有的课程模式未形成前后相继的整体体系。实践类课程如专业实习、认知实习、项目实训、毕业实习、毕业设计等实践类课程都是相互独立的，未形成前后相继的关联性。教育过程中较少关注学生创新思维和创造能力的培养，忽略学生创业个性化发展。
1.3 创业实践平台建设滞后
在应用型高校中实验室建了很多，但其中能够为学生提供自主创业活动的创业实训中心却很少，校企合作型的设计实习基地只浮于表面，较少为学生提供真正的实习机会，导致学生了解社会需求、行业发展和接触生产实践的机会较少，创业热情大大被削弱。
1.4 创业指导的师资力量匮乏
目前，高校师资队伍中缺乏既精通专业创新知识又拥有丰富创业实践经验的教师。部分高校由无创业经验或未受过系统创业教育的教师讲授课程，存在实践指导能力低、教学方法单一、实效不强等问题。大部分教师仍持有传统的教学观念，不注重学生个性的发挥与创造力的激发，不鼓励提倡学生的自主设计创业实践活动。