要对民办高职进行有效的管理，就必须了解它的特殊性，这样才能一把钥匙开一把锁，管理才有针对性。民办高职的特殊性主要表现在以下几个方面:
（一）从投资者来看，民办高职之所以称为民办，就是因为它是社会力量办学，不是国家出资。对绝大多数民办高等院校而言，学费收入是办学经费的主要或全部来源。
（二）从政府定位来看，民办高职只不过是国家在财力紧张，而社会又对高素质技能型人才有大量需求的形势下，所做的一个必要的补充。许多民办高职把自己拔高按公办高职甚至是普通高校的标准来要求，只不过是自作多情而已。而国家在对民办高职进行评估的时候，要按公办高职甚至是普通高校的标准来，也明显是一种“又要马儿跑，又不给马儿吃草”的做法。
《民办教育促进法》明文规定，民办教育属公益事业，不以盈利为目的，短时间是不可能有收益的。但国家财政却很少支持，教育资产又不能作为抵押申请银行贷款，只能借高利贷，许多民办高校债台高筑，举步维艰，民办高职教育经费紧张已成为制约民办高职发展的突出问题。但即便如此，许多地方政府在财力充足的情况下也是见死不救，对加大对民办高校的扶持力度、提高民办高职教师待遇的呼声也是充耳不闻，仅在口头上非常重视。
民办高等职业教育是高等教育的重要组成部分，是以培养生产、建设、管理、服务第一线的高技术应用型专门人才为目标的教育类型。但由于资金紧张，迫使民办高职重效益、轻投入，后果就是：1、财务、会计等“短、平、快”专业开设较多，而经济社会发展紧缺的技术技能型人才专业，如装备制造、石化工业、船舶工业等设置较少，专业分布未能与人才市场需求良性匹配。2、许多民办高职只能做面子工程，看得见的校舍、硬件等就投入，而看不见的软件、内涵建设的需要就不愿投入，造成许多硬件是废铁一堆。
（三）从生源来看，民办高职的学生是高考录取的最后一批，大部分学习基础较弱，学习能力不强。缺乏正确的学习方法，学习上独立性、自主性、探究性均低于普通大学生。厌学情况较普遍，不爱看书，不喜欢长时间坐在教室里听老师讲课，静不下心来是高职生的显著特点。高考造成的巨大阴影以及长期学习受挫的经历使得这些学生与本科生相比缺乏自信。大部分都是独生子女，在家被父母和爷爷奶奶过分溺爱，习惯于自我为中心，养成了自私任性的性格。针对这样的学生怎样因材施教，怎样提高教学质量，是摆在民办高职管理者面前的首要任务。
（四）从民办高职的教师来看，民办高职的教师主要有三种来源，一是从高校毕业不久的本科生和研究生，二是来自于企业的求稳者或经营失败者，三是从普通高校或公办高职退休的教师。这三类中，前两类基本没有什么教学经验，也基本没有什么科研成果。第三类退休教师，有比较丰富的教学经验，也有较多的科研成果和科研经验。但是，他们来民办高职的主要目的是发挥余热，更多的是侧重享受，所以让他们在民办高职继续搞科研，出科研成果的可能性不大。同时，他们的教学经验主要是适合本科生和研究生的教学，有很多在教这些基础较差的民办高职生的时候效果并不理想。再加上知识更新缓慢，还有些老教授侧重搞科研，教学水平本来就比较差等原因，退休教师在民办高职提升教学质量中发挥的作用也不明显。