程穆衡生于清康熙四十一年（1702），卒于乾隆六十年（1795），寿至耄耋，时所罕见，祖籍安徽休宁，《吴梅村诗笺》自撰凡例中所称之“先祖篁敦公”，乃明朝成化年间名臣程敏政。曾祖父程其谟有诗文存世，程穆衡所编《舄吟集》始于明偶恒，终于其曾祖其谟。外祖杨桢，字宁侯，著有《慤庵集》，家富藏书。父程继默时迁江苏太仓鹤市。程穆衡于乾隆元年（1736）中举，二年（1737）中进士，授山西榆社知县，治县有方，政绩颇丰。后因得罪上官罢归，除曾协助纂修《镇洋县志》外，再无仕途之行迹，大半生以著述为乐，子程师慤，字原夫。程穆衡少时，外租家富藏书，且多诗集藏本，据嘉庆《直隶太仓州志》卷五十四“《舄吟集》”下双行小字：“自序云：‘余家藏诗集至侈，多承王父慤菴先生据梧斋副本，幼而承习。后登仕籍，沉迷簿领，风雅一途寄焉而已。’”这对于程穆衡以后学术格局的形成无疑起着至为重要的奠基作用。
程穆衡著述颇丰，广涉四部，据《中国古籍总目》和南京市图书馆藏目录来看，共39部书稿，涉及经部如《考订檀弓》《夏小正注疏》，史部如《准噶尔考》《金川纪略》《娄东耆旧传》等，子部如《燕程日记》《据梧斋尘谈》《鞶帨巵谈》等。至于集部则在《水浒传》注解、辑录后人的和陶诗、吴梅村诗歌笺释等方面建树颇丰。这些著作除少数几种如《考订檀弓》《夏小正注疏》《水浒传注略》等有小范围刊刻外，大部分均未付梓刊行，且以稿、钞本形式存于南京、上海等图书馆。程穆衡耗时几十年之功所作的《吴梅村诗笺》，虽然也无法避免这样的命运，但《吴梅村诗笺》的稿本能够跨越几百年的时间，至今尚存于霄壤之间，几种钞本亦辗转存于后世，未尝不是一件幸事。